組織系統
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本院設置董事會、院長室、八個研究所、台灣氣候變遷研究中心、電力與能源研究中心、產業低碳數位轉型中心、淨零產業發展研究中心、景氣預測中心、財經諮詢委員會、行政處及圖書資訊室等，其職掌如下：
( 一) 董事會掌理本院大政方針之規劃與決定、本院組織之編制與管理、本院部門主管之遴選與任免、本院資金之籌集運用與管理等事宜。董事長綜理事務，對外代表本院。
( 二) 院長室承董事會暨董事長之委任，掌理本院業務之企劃、考核、機要、協調、公共關係、國際事務，以及配合研究業務拓展需要設置各項定期性專案辦公室等事宜。
( 三) 八個研究所分別從事經濟、社會、產業、運輸、文化、科技、能源、環境、財政、金融、勞動、中小企業和國際關係等公共政策綜合研究事宜。
( 四) 台灣氣候變遷研究中心掌理氣候減緩、調適、永續發展及產業淨零轉型之技術、策略等研究事宜。
( 五) 電力與能源研究中心掌理電力技術、電力經濟、電力市場、再生能源、電網與儲能等電力與能源跨領域之研究。
( 六) 產業低碳數位轉型中心掌理產業低碳數位雙轉型之政策與策略規劃，推動因應國內外碳管制趨勢下淨零產業數據化、計價化、資產化、效益化之市場機制。
( 七) 淨零產業發展研究中心掌理淨零碳排、減碳策略、負碳技術等產業淨零轉型之研究。
( 八) 景氣預測中心負責本院經濟預測模型，定期對外發布國內外經濟展望之見解與預測。
( 九) 財經諮詢委員會係結合產官學研各界菁英設置「財經論壇」，定期針對國內外財務金融、產經情勢等即時性且重要之議題，舉辦公開研討會與演講會。
( 十) 行政處掌理人事、會計、總務、文書與資訊等事宜。
( 十一) 圖書資訊室掌理圖書資料採購、建置與資訊管理等事宜。
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研究一所研究一所從事國家電力管理及電業經營政策等研究，著重於電力供需、能源價格、電業永續發展政策、電業相關法規、電業經營效益評估、電價模擬分析、電業組織變革、經營管理、營運模式、經營績效評估等研究議題，進行客觀研究分析與提出具體可行方案。
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研究二所研究二所從事油氣、新材料產業經濟與能源管理等綜合研究，著重於能源產業發展、石油供應安全及其應變機制、油氣市場管理等領域。包括：著重於石油產業政策與競爭策略、能源領域之國際經貿競合、能源供需與價格預測、石油煉製與石化產業發展規劃等議題。
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研究三所研究三所從事經濟及產業分析預測，致力氣候減緩、調適與永續發展議題之相關研
究。研發並運用3E( 能源、環境、經濟) 科學分析模型，服務產官學研各界，協助其政策研擬、經營戰略、效益分析，以及對環評與氣候法規之影響評估。研究內含包括：總體經濟預測( 每年年中與年末定期公開發表「台灣經濟展望」報告)、淨零碳排路徑與碳定價、綠色金融與永續投資、企業碳權經營與管理、社會對話與公正轉型等議題。
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研究四所研究四所從事能源政策、能源統計研究，負責總體能源政策規劃、能源法規制度研析、政策環境影響評估、性別主流化業務推動、能源政策溝通宣導、能源供需資料蒐集與刊物編製、溫室氣體排放統計、部門能源消費調查、能源流程圖編製、能源統計法規與制度檢討、能源指標分析等議題。
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研究五所研究五所致力於電力工程、高壓用電設備研究，設立「用戶用電裝置諮詢服務專案辦公室」，協助政府修訂電力工程技術規範，提供諮詢服務。深耕電力交易、再生能源、電業管理、電力資源整合等電力領域研究。透過長期與國際電業、能源顧問公司交流合作，引進最新電力技術。協助政府建立電力交易平台，健全電力市場，達成我國能源轉型、電業自由化與能源供應多元化之目標。擘劃未來電力負載需求預測、電力技術經濟分析、碳中和以及電力技術發展路徑，並提供儲能等新能源投資諮詢服務。
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研究六所研究六所從事偏鄉油氣政策、液化石油氣產業經濟等綜合研究，著重於偏鄉油源供應穩定、偏鄉民眾能源消費權益保護、液化石油氣市場交易秩序管理等領域。包括：偏鄉油氣市場供需、偏鄉地區群體用油權益政策、液化石油氣事業經營管理等議題。
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研究七所研究七所從事國內外淨零轉型、溫室氣體減量法制規範及推動策略相關研究，著重國際氣候公約與氣候變遷減緩策略分析、國內外碳管制機制執行進展及淨零轉型路徑、策略與配套規劃等研究，並協助政府進行產業減碳輔導交流、運作淨零推動相關跨單位整合平台，以及對外溝通強化等事宜。
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研究八所研究八所推動我國再生能源發展，達成2050 淨零排放目標。設立「再生能源發電設備認定及查核作業計畫辦公室」，協助執行與輔導地方政府辦理再生能源發電設備認定及查核等事宜，並提供設置者相關諮詢服務。協助政府修訂「再生能源發展條例」相關子法，進行再生能源設置情形之統計及分析。設立「再生能源義務用戶輔導專案辦公室」，輔導企業履行再生能源義務，協助企業善盡社會責任及建立使用綠電典範，提升產業競爭力，辦理再生能源義務用戶線上申報及相關諮詢服務。
